Má celkem 50 členů a skládá se ze zástupců řídicího orgánu, zprostředkujícího subjektu a zástupců partnerů (ministerstva, krajů, obcí, nestátních neziskových organizací, profesních organizací apod.). Každý člen monitorovacího výboru má hlasovací právo. Evropská komise se účastní činnosti monitorovacího výboru jako poradce.

Monitorovací výbor se schází nejméně jednou ročně a posuzuje aktuální stav, realizaci programu a pokrok při plnění stanovených cílů. Zohledňuje například finanční údaje, společné ukazatele a ukazatele specifické pro daný program a další.

Monitorovací výbor se sejde v Jáchymově. Informace o dosavadních jednáních Monitorovacího výboru OPST je možné dohledat na webu Operačního programu Spravedlivá transformace.